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图1所示。生殖系改变景观的遗传性胃癌扩散
生殖系改变景观的遗传性胃癌扩散

Oncoplot显示生殖系改变景观在284中国世袭扩散胃癌患者。前面板显示的总nonsilent生殖系改变对于每个样本。中间面板显示变更细节;只有基因改变频率的8%或更大的显示。底部面板显示了临床信息。万博manbetx平台首页癌症的分期是基于与癌症分期手册,第七版。希伯表明eb病毒编码小rna。

图2。生殖系的变化背景MUC4
生殖系改变背景和MUC4
图3。遗传性胃癌扩散的体细胞改造景观
遗传性胃癌扩散的体细胞改造景观

Oncoplot显示体细胞改造景观在186中国世袭扩散胃癌患者。前面板显示的总nonsilent体细胞变化为每个样本。中间面板显示变更细节;只有24最改变基因改变频率的7%或更大的显示,用红色字体表示有重大改变的基因。底部面板显示了临床信息。万博manbetx平台首页癌症的分期是基于与癌症分期手册,第七版。希伯表明eb病毒编码小rna。

图4。基因和体细胞拷贝数变化而发生明显改变
基因和体细胞拷贝数变化而发生明显改变

,显著改变基因(使用MutSigCV < . 05)检测算法。低值被限制在一个固定的值,因为加工精度的限制。B, G得分的基因组区域绘制基因组,橙色代表峰值显著提高拷贝数和深灰色的峰值代表重要的拷贝数的损失。浅灰色峰值表示微不足道的得失。关键基因与胃癌相关的红色所示类型,和癌症普查基因(目录的体细胞突变在癌症签名数据库)与其他肿瘤类型所示绿色类型。

表。世袭扩散胃癌患者临床病理特征包含在血液或肿瘤样本测序分析
世袭扩散胃癌患者临床病理特征包含在血液或肿瘤样本测序分析
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的观点 2138年
最初的调查
遗传学和基因组学
12月9日,2022年

Whole-Exome测序在中国世袭扩散胃癌患者

作者的从属关系
  • 1华南肿瘤学国家重点实验室合作创新癌症医学中心,中山大学癌症中心,广州,中华人民共和国
  • 2医学肿瘤学部门,佛山第一人民医院,禅城区,佛山,中华人民共和国
  • 3分子诊断、中山大学癌症中心,在华南肿瘤学国家重点实验室,合作创新癌症医学中心,广州,中华人民共和国
  • 4医学肿瘤学部门,中山大学癌症中心,在华南肿瘤学国家重点实验室,协同创新中心癌症医学、广州,中华人民共和国
  • 5癌症预防、中山大学癌症中心,广州,中华人民共和国
  • 6胃手术,中山大学癌症中心,在华南肿瘤学国家重点实验室,协同创新中心癌症医学、广州,中华人民共和国
  • 7研究中心的精确诊断和治疗胃肠道癌症,中国医学科学院,广州,中华人民共和国
JAMA Netw开放。 2022;5 (12):e2245836。doi: 10.1001 / jamanetworkopen.2022.45836
要点

问题生殖系改变的发生率是多少背景已报道,作为一个易感性基因存在于25%到50%的患者遗传性胃癌扩散(HDGC),和有潜在疾病易感性的遗传基础剩下50%到75%的患者HDGC吗?

发现在这个队列研究284年中国HDGC患者的频率背景生殖系改变很低(2.8%),和生殖系变化,插入和删除最常发现的MUC4,ABCA13,ZNF469,FCGBP,IGFN1,RNF213,SSPO。等基因的双重打击事件CACNA1D观察患者HDGC。

意义这个研究结果挑战之前报道的频率高背景生殖系改变HDGC和表明,双重打击事件可能作为HDGC肿瘤发生的重要机制;这项研究还提供了一个遗传景观和确定新的HDGC易感基因。

文摘

重要性钙粘蛋白的基因,背景α-E-catenin基因,CTNNA1,以前确认为遗传性胃癌扩散(HDGC)易感基因,解释HDGC病例的25%到50%。疾病易感性的遗传基础剩下50%到75%的患者HDGC仍然是未知的。

客观的评估的发生率背景生殖系改变HDGC,识别新的易感基因可用于筛选HDGC,并提供一个遗传HDGC景观。

设计,设定和参与者这个队列研究进行回顾whole-exome和有针对性的测序284白细胞样本和186来自中国患者的肿瘤样本配对HDGC长随访期间(中位数,21.7,0.6 - -185.9个月)。431名诊断为胃癌之间的1月1日2002年8月31日,2018年,284名患者符合HDGC的标准都包括在内。从2020年8月1日至30日,数据进行了分析。

主要结果和措施的发病率背景生殖系变化,识别新的HDGC易感基因,基因HDGC的景观。

结果284中国病人中,161(56.7%)是女性,平均年龄为35岁(范围、20 - 75)年。的频率背景生殖系变化为2.8%,而的频率背景体变化为25.3%。发病率最高的基因(> 10%)的私人生殖系改变(包括插入和删除)HDGC队列MUC4,ABCA13,ZNF469,FCGBP,IGFN1,RNF213,SSPO,而之前报道生殖系的变化CTNNA1,BRCA2,STK11,PRSS1,自动取款机,MSR1,PALB2,乳腺癌易感基因1,RAD51C观察在低频率(平均4(范围1 - 12)情况下)。此外,浓缩接触黄曲霉毒素的体细胞变异特征提出潜在HDGC基因和环境之间的相互作用。等基因的双重打击事件CACNA1D观察,认为这些事件可能成为HDGC肿瘤发生的重要机制。此外,生殖系的变种FSIP2,HSPG2,NCKAP5和体细胞变化FGFR3,ASPSCR1,中投公司,DGCR8,LZTR1与贫穷有关HDGC患者总生存期。

结论和意义这项研究提供了一个遗传HDGC景观。之前报道的研究结果挑战了生殖系变更率高背景在HDGC和识别新的潜在的易感基因。分析变异签名和双重打击事件透露潜在HDGC肿瘤发生的重要机制。从目前的研究结果可能为进一步调查HDGC提供有用的信息。万博manbetx平台首页

介绍

胃癌(GC)是第五位最常见的癌症和第三个全球癌症死亡的最常见原因。1东亚的疾病尤为常见。2尽管大多数GCs偶尔发生,家庭中的聚合发生在约10%的病例。3它现在已经建立了3%到5%的GCs GC倾向综合症与遗传有关,包括遗传扩散GC (HDGC),胃腺癌和近端胃息肉病,家族性肠GC。4- - - - - -6

遗传扩散GC被认为是与遗传易感性有关。钙粘蛋白的基因,背景,以前确定HDGC易感性基因,解释HDGC病例的25%到50%。7- - - - - -9运输异常背景基因赋予GC率大于80%。5α-E-catenin基因改变,CTNNA1已经被确认为额外的遗传因素与HDGC相关联。10在一个大型HDGC血统,生殖系删除等位基因CTNNA1出现在2家人入侵扩散GC和4家人intramucosal印戒细胞检测内镜监测的一部分。10此外,GC与先前报道的其他相关联的风险增加HDGC易感基因,包括乳腺癌易感基因1,一种,MSH2,MSH6,PMS2,PALB211然而,改变的速度背景在东亚病人和遗传基础的底层易感性在剩余的50%到75%的患者HDGC仍然未知。

测序技术的进步导致了开创性研究分析弥漫型的基因组景观和non-diffuse-type gc。12- - - - - -17癌症基因组图谱(TCGA)项目进一步提供multinomics-based胃腺癌的分子特征。14罗伯茨等人18定义家族性的遗传异质性通过全基因组测序胰腺癌。HDGC是基于临床的诊断标准,包括诊断年龄、家族史、和劳伦分类,3但是,理由包括个人被诊断为分散GC 40岁之前没有疾病的家族史值得进一步考虑。因此,特征的分子肖像需要进一步了解肿瘤发生的临床HDGC定义。这个队列研究旨在评估的发病率背景生殖系改变HDGC,识别新的HDGC易感基因,并提供一个遗传HDGC景观。

方法

执行这个回顾性队列研究符合赫尔辛基宣言19并通过中山大学癌症中心的伦理委员会。所有参与者提供同意报告和发布他们的个体患者数据。本研究遵循加强流行病学的观察性研究报告(选通脉冲队列研究)报告指南。

我们检查的临床资料431患者被诊断出患有GC 中山大学癌症中心在1月1日2002年8月31日,2018 (eFigure 1补充1)。从2020年8月1日至30日,数据进行了分析。患者包括如果他们遇到了至少1 4 HDGC标准:(1)诊断为2或更多情况下扩散GC的GC或1例确诊病例——或二级亲属在50岁之前;(2)3或更多的确诊病例扩散GC在第一或二级亲属,发病年龄的独立;(3)诊断弥漫性GC 40岁之前,没有扩散GC的家族史;(4)个人或弥漫性GC和小叶乳腺癌的家族史,1岁之前被诊断为50年。总体而言,542年的10 431名患者(5.2%)从中山大学癌症中心符合HDGC的标准;其中,177名患者白细胞样本不足和83名患者没有详细的后续数据被排除在外。剩余的282包括HDGC患者,患者和2 HDGC佛山市第一人民医院的被添加到示例中,共有284名参与者。

Whole-exome测序进行284 HDGC白细胞样本和186肿瘤样本配对(eTable 4补充2)。因为HDGC是一种罕见的疾病,生殖系变化的分析集中在私人变体。私有变量被定义为(1)废话变化,剪切位点的改变,和移码插入和删除(indels);(2)在生殖系变异杂合的;(3)变异小于0.5%小等位基因频率在1000基因组项目20.中国Millionome数据库或数据库21;(4)变异出现在只有1例;(5)变异mappability得分大于0.5;(6)变异和没有额外的基因位点在咩咩的叫声对齐工具基于查询。22考虑到大多数的已知high-penetrance疾病有关的变异位于编码区,只有位于这些区域被认为是基因改变。

MutSigCV算法,1.41版本,23被用来检测显著改变基因(与意义在哪里< . 05)。体细胞拷贝数改变(大会)被发现使用Control-FREEC算法,11.1版。24GISTIC2.0算法25被用来确定地放大或删除HDGC群体的基因组区域。G得分计算测序地区基于的频率和振幅放大或删除在每个基因。双重打击事件被定义为一个杂合的生殖系变更,成为纯合,可能扩大生殖系改变所带来的影响,可能与肿瘤发生有关。额外的细节目标捕获测序;体检测单核苷酸变异(SSNVs) indels,大会;双重打击事件分析;和药物在eMethods提供目标分析补充1

统计分析

比较分类变量之间双向的P使用费舍尔准确或χ值计算2测试。多个测试修正的错误发现率计算使用Benjamini-Hochberg过程。使用kaplan meier生存函数的估计进行了估计和生存率较。所有统计分析使用R软件,版本3.5.0 (R统计计算的基础)。统计学意义是双向的P< . 05。

结果

284中国病人中,161(56.7%)是女性,平均年龄为35岁(范围、20 - 75)年。大多数病人有三期或四期GC(190例[66.9%])和被诊断为弥漫性GC在40岁之前,没有家族史的漫射GC(254例[89.4%])。平均随访21.7个月(范围0.6 - -185.9)。只有8例(2.8%)阳性结果巴尔病毒感染,感染率低于之前报道的患者GC。265年生存率为61.4%(95%可信区间,53.2% -68.6%),这是高于44.1%的存活率的一项研究报告的零星分散患者GC。27额外招收患者所示的临床病理特征,进一步的细节的队列和外显子组测序在eResults提供患者样本补充1

生殖系变异分析

基于所确定的私人生殖系变异(图1),我们检查基因可能与易感性HDGC(变体验证eTable 5所示补充2)。一项研究报道,HDGC病例的40%背景生殖系变化。28然而,我们发现背景生殖系错义变化和indels HDGC 284年仅8例(2.8%)(图26),所有的错义变化和2 indels没有先前报道。即使在有家族史的患者弥漫性GC HDGC队列,的频率背景生殖系改变还低(3.3%)。低频率的背景生殖系变异建议不同的遗传背景和HDGC东亚人群的致癌作用机制。此外,先前的研究建议CTNNA1,BRCA2,STK11,SD乙肝,PRSS1,自动取款机,MSR1,PALB2,乳腺癌易感基因1,RAD51C可能与易感性有关非吗背景变体HDGC。28,29日在我们的研究中,生殖系单核苷酸多态性和indelsCTNNA1观察2 HDGC情况下,BRCA2在12例,STK11在2例,PRSS1在2例,自动取款机在5例,MSR1在4例,PALB2在6例,乳腺癌易感基因1在6例,RAD51C在1例。在SD没有发现变化HB。此外,观察到的生殖系单核苷酸多态性和indels在这些基因不同于以前的研究报道。28,29日发病率最高的基因(> 10%)的私人生殖系变异HDGC队列MUC4(19%),ABCA13(10%),ZNF469(10%),FCGBP(10%),IGFN1(10%),RNF213(10%)和SSPO(10%)(图1);这些改变并没有之前报道。之前报道的改变和indelsCTNNA1,BRCA2,STK11,PRSS1,自动取款机,MSR1,PALB2,乳腺癌易感基因1,RAD51C观察在低频率(平均4(范围1 - 12)情况下)。最经常改变基因,私人生殖系的变种MUC4观察284年53例(18.7%)与HDGC (图2B)。这些基因是小说候选人和显示不同光谱的生殖系HDGC改变。

因为大多数错义的功能意义变异是未知的,我们集中分析过早删除变体(PTVs)的私人变异;这些PTVs包括转移indels、废话变化和剪切位点改变根据一项研究的结果。182278年总共有2715私人杂合的PTVs基因被确定。最改变基因,MUC4有7个PTVs,而WDR87,CRIPAK,DNAH7,EFCAB13,ITGAV都有4 PTVs (eFigure 2补充1)。先前的研究30.,31日提出,MUC4可以诱导小鼠成纤维细胞的致癌性转化吗30.过度的MUC4可能通过促进积极的属性ERBB2(原HER2HER2 / neu在胃腺癌)信号。31日改变的ITGAVPI3K信号的监管机构,也曾观察到GC肿瘤组织。32因此,尽管功能后果的私人PTVs未知,标识的一部分私人PTVs参与发现了GC的发展,而这些私人PTVs可能与易受HDGC和作为创始人的改变。

体细胞变异分析

除了生殖系变化,异形的体细胞变异186 HDGC配对样本(变体验证eTable 5所示补充2)。最改变基因TP53,频率为32.3%(60 186样品)(图3)。值得注意的是,尽管生殖系变异的频率很低在我们的数据集,的频率背景体细胞变化高达25.3%(47 186个样本)。因为只有5背景体细胞改变成对外周血中发现了,只有1支持读取每个潜在的宪法镶嵌性,这是一个著名的机制多个遗传癌症相关的基因,是不支持在我们的数据集。除了有重大改变的基因和indels,包括TP53(< 2.2×1016),背景(< 2.2×1016),ARID1A(= 8.7×108;29日的186个样本与改变[15.6%])(eFigure 4补充1TCGA),以前确定在一个队列的患者胃腺癌(STAD)频率(11%),12MutSigCV算法确定了几个SMG基因,包括HRCT1,KRTAP5-4,RAB21,PIGR,FAM136A,TGFBR2,BAP1,ELF3根据我们的数据集(图4一个;eTable 1补充2)。

此外,我们比较了蚀变负担HDGC和零星分散STAD TCGA (D-STAD),发现改变HDGC负担相当与D-STAD (eFigure 3补充1);HDGC和D-STAD有类似的基因改变的频率(R= 0.24;P< 2.2×1016)(eFigure 3 b补充1)。我们发现了几个高度改变基因D-STAD在HDGC变更频率明显降低(eFigure 3 c补充1)。例如,改变频率FAT4在HDGC D-STAD是22.9%,但只有4.3% (eFigure 3 b补充1)。此外,改变频率MLLT4在HDGC D-STAD是10.0%,但0% (eFigure 3 c补充1)。尽管HDGC拷贝数变异频率相对类似D-STAD不同的基因组区域(R= 0.37;P< 2.2×1016)(eFigure 3 d补充1),拷贝数变异频率许多地区是明显不同的,包括几个不同的染色体arm-level地区(例如,删除chr16p, chr17, chr19, chr20,和chr22)和许多焦点区域(例如,更多放大频率在chr6p21.32-33 chr6p22.1-2和删除chr7p11频率,染色体1和7的开始和结束的染色体8,9,10,12)(eFigure 3 e补充1)。

的帮助下从whole-exome测序,测序覆盖信息的大会HDGC也被评估。万博manbetx平台首页chromosome-level大会(图4B) GISTIC2.0算法计算表明,大量的大会事件发生在HDGC肿瘤组织。基因组等地区6 p22.2 19 p13.2地放大,而1 q21.3等地区和10 q21.3地删除。能够进一步分析结果显示已知的癌症相关基因的大会,等PTK6(44.6%),ERBB3(13.4%),PIK3CA(11.8%)和UBR5(11.8%),相对频繁(eFigure 4补充1)。一项研究发现了metastasis-promoting的角色PTK6,33和贾等人34提出,PTK6正在积极的选择和相关吗幽门螺杆菌入侵;发现放大和删除PTK6观察肿瘤的争议(eFigure 4补充1)。著名的致癌基因,ERBB3PIK3CA据报道,参与GC,35,36和高度频繁放大观察这些基因的人群(eFigure 4补充1)。E3连接酶,调节蛋白质泛素化降解,UBR5据报道,破坏肿瘤抑制GKN在GC,37和频繁的放大UBR5本研究中发现进一步表明其潜在的致癌作用(eFigure 4补充1)。虽然Control-FREEC和GISTIC2.0算法已经广泛使用,据报道,可靠,38- - - - - -40额外的方法,还需要进一步的研究来验证大会结果和揭示的机制。

MAPK信号通路,包括PI3K-Akt,细胞周期,Wnt和TGF-β,以前认为是重要的致癌作用和发展GC。41在这项研究中,我们发现这些通路的体细胞变异频率为HDGC队列(eFigure 5补充1)和TCGA STAD队列(eFigure 6补充1),显示不同的配置文件。一般来说,这些通路的体细胞变异频率,TCGA队列是大大高于HDGC队列。例如,改变利率PIK3CA,喀斯特,SMAD4,MYC,APCTCGA STAD组高于变更率HDGC队列(eFigure 5 a - c和eFigure 6 a - c补充1)。细胞周期的改变利率途径TCGA的STAD队列都大大低于HDGC队列(eFigure 5 d和eFigure 6 d补充1)。此外,大会在HDGC队列的频率高于TCGA STAD队列。综上所述,零星的GC的重要途径可能有一个小角色HDGC的致癌作用。

病原学的分析

调查HDGC的病因,变异特征分析及相关的目录执行体细胞突变在癌症数据库(eMethods(宇宙)签名补充1)。结果显示,签名1 (5-methylcytosine病因:自发的脱氨基作用)、5(病因:未知),签名和签名24(病因:接触黄曲霉毒素)丰富的队列(eFigure 7 a - b补充1),呈现不同的改变频谱TCGA STAD队列。此外,浓缩的签名24当集群的数量是4是一致的(eFigure 7 c补充1)或5 (eFigure 7 d补充1)。3变种的分布特征在样本提出了eFigure 7 e补充1。签名24中没有检测到,TCGA STAD群但发现作为一个占主导地位的签名在186年的11个样品(5.9%)从HDGC患者在我们的研究中(eFigure 7做减法补充1)。患者签名24优势在巴尔病毒呈阳性的子群身上丰富(2 3例和8 69例virus-negative子群;费雪P= .04点)(eFigure 7 h补充1)。此外,改变基因签名24很重要,包括TP53,WDR87,PCDH9,SP8,CNTN4,PIK3CA,TMEM132C(eFigure 7我的补充),这可能与接触黄曲霉毒素有关。这些结果表明,在HDGC环境因素可能有很大的作用,有可能是大量基因和环境之间的相互作用。

为了进一步阐明肿瘤发生机制,我们分析了HDGC双重打击事件。共有406个潜在的双重打击事件被确定在396年来自66名患者的基因(意思是,2(范围、0-46)事件)(eTable 2补充2)。双重打击事件的发现数与nonsilent生殖系变异数,杂合性丢失事件计数和杂合性丢失区域大小(eFigure 8 a - c补充1)。总共35 66例(53.0%)只有1或2双重打击事件,而有超过20从5例双重打击事件。只有一个双重打击事件是386年观察到的基因,而有其他10基因2双重打击事件。例如,1病人最双重打击事件事件(46),其中CACNA1D观察p。I264V变更,另一个病人2双重打击事件,其中CACNA1D观察p。R2101问alteration (eFigure 8D-G in补充1)。双重打击事件中发现另一个14宇宙癌症普查基因从患者HDGC eFigure 9所示补充1。这些基因只有1双重打击事件,表明足够的证据来支持他们的潜在角色肿瘤发生机制。虽然还需要进一步的研究来阐明功能和机制的双重打击事件,这些结果表明,双重打击事件可能HDGC的重要机制。

临床结果的改变和可操作的变体

除了癌症肿瘤形成和发展,我们检查临床outcome-related HDGC变体。结果显示,nonsilent生殖系改变7基因,包括SDK1,HSPG2,FSIP2,CUBN,NCKAP5,FLNB,MUC16显著相关,与总生存期(OS) (eFigure 10补充1)。在这些基因中,MUC16(eFigure 10 b补充1)是一种已知的致癌基因注释在宇宙数据库,和多变量Cox比例正义前锋回归分析表明,生殖系的变化NCKAP5(eFigure 10 c补充1),HSPG2(eFigure 10 d补充1),FSIP2(eFigure 10 e补充1)独立因素与患者的临床结果HDGC (eFigure 10 f-h补充1)。此外,体细胞变化(包括nonsilent改变和大会)在大量的基因被发现与操作系统(eFigure 11补充1)。其中,宇宙癌症普查基因,包括FGFR3(风险比[HR], 2.2;95%置信区间,1.2 - -4.2),ASPSCR1(HR 2.2;95%置信区间,1.2 - -4.1),中投公司(HR 2.4;95%置信区间,1.2 - -4.7),DGCR8(HR 2.2;95%可信区间,1.1 - -4.5),LZTR1(HR 2.5;95%置信区间,1.2 - -5.3),在高频率改变(> 10%),独立及其变化与操作系统(eFigure 11 b-f较差有关补充1)。因为FGFR3是一个著名的癌症相关基因,我们进一步相比其变更概要HDGC和TCGA STAD军团。我们发现,改变频率,特别是删除频率,大大高于那些在HDGC队列(25.8%)与TCGA STAD队列(1.4%)(eFigure 11 g补充1)。

此外,路径分析发现体细胞的基因改变与贫穷有关操作系统丰富interferon-related途径,包括干扰素信号,干扰素α和β信号,调节干扰素α信号,DDX58 -IFIH1介导的诱导干扰素α和β,抗病毒与响应相关的通路TRAF6介导的IRF7激活,参与发展巨核细胞和血小板生产要素(eFigure 11 h补充1)。与更好的操作系统相关的基因变化丰富的酪氨酸kinase-regulated途径,包括nonreceptor酪氨酸激酶的信号,信号通过PTK6的差别,对这些ERBB2ERBB3信号,ERBB2激活PTK6信号,规范化类维生素a周期棒(暗视觉),和IKK复杂的招聘由RIP1(eFigure 11我在补充1)。这些结果表明,信号和异常的干扰素PTK6信号可能在HDGC的发展发挥着重要作用。

除了对OS,体细胞变异的潜在临床可控诉的情形是根据临床可控诉的情形的ESMO规模评估分子靶点OncoKB数据库,通过整合数据42癌症基因组的翻译,43和公民(在癌症临床解释变异)数据库。44总共263 21 345 SSNVs HDGC患者(1.2%)在125年和338年469年582年大会(0.07%)从153年HDGC患者标注为可操作的(eTable 6补充2)。注释结果eTable 3所示补充2和eFigure 12 a - b补充1。这些发现表明可行的变体是罕见的SSNVs和大会,和证据水平的分布是不同的。根据DrugCVar系统,45证据水平的可行的SSNVs(203 263[77.2%])高于4层,而大部分的可操作的大会(239 338[70.7%])层4。这些结果可能会有利于HDGC患者治疗的进一步发展。

讨论

在这个队列研究中,我们回顾检查超过10 000例GC在过去的16年,建立了一个群284 HDGC患者,发现542的10 431名患者(5.2%)与GC符合HDGC的标准,这与先前的估计是一致的。3HDGC队列大多数病人(89.4%)没有扩散GC的家族史,他们包括根据扩散GC的标准诊断岁前40年。虽然先前的研究发现,年轻患者,特别是那些35岁以下,有不良预后,46目前的研究发现更高的患者5年操作系统速度HDGC患者(61.4%)比零星分散GC(44.1%),建议HDGC之间不同的生物学行为和零星分散的GC。

在这项研究中,异形的遗传景观HDGC队列的挑战以前的观测背景生殖系变更存在与HDGC 25%到50%的家庭28;这些发病率是不适合中国患者HDGC在当前的研究中。即使在有家族史的患者弥漫性GC HDGC队列,的频率背景生殖系改变还低(3.3%)。这是以前报道,背景操作系统,差的改变有显著相关47这与我们的研究结果是相一致的。此外,没有观察到非常常见的生殖系改变这一群人,这表明遗传因素与HDGC需要进一步调查。

除了基因的改变可能与致癌作用有关,我们确定了在HDGC OS-associated基因改变,其中一些以前报道。例如,李et al48报道之间的关联MUC16改变和结果患者GC,另一项研究12发现中投公司基因是高度改变患者,TCGA STAD队列,和阳等49发现变更频率MUC16FSIP2在东亚GC患者高。此外,我们评估了体细胞变异的潜在临床可控诉的情形。大会做分析的基础上,药物针对mTOR的放大,到CDK6,纤维母细胞生长因子受体满足,ERBB2是最常见的。体单核苷酸变异药物候选人包括变异ARID1A、PI3KCA SMARCA4,表皮生长因子受体,软面包卷。直到现在,只有药物目标ERBB2VEGF患者已经被批准用于治疗转移性GC,和结果不令人满意。本研究提供的信息,可以有利于未来临床试验的药物靶向基因万博manbetx平台首页改变HDGC患者。

限制

本研究也有一些局限性。首先,这项研究回顾和包括中国患者只有2网站。可能存在遗传背景的差异东亚与西方人群。进一步国际多中心前瞻性研究将有助于更好地理解HDGC的基因特性。第二,94.0%的患者在这项研究是比40年,年轻没有扩散GC的家族史,这或许可以解释的改变率低背景。额外的研究包括患者不同的条件,尤其是那些与小叶乳腺癌的家族史或个人历史,都是合理的,因为患者不同条件并不包括在目前的队列。第三,可操作的基因改变的发生率很低,这可能限制该研究结果的应用,和不同的化疗患者受到HDGC在这项研究中难以控制的因素,评估化疗prognosis-related事件,如同源重组修复基因的改变。

结论

这个队列研究提供了一个遗传景观HDGC挑战以前报告生殖系变更率高背景在HDGC和识别新的潜在的易感基因。分析变异签名和双重打击事件透露HDGC肿瘤发生的重要机制。据我们所知,目前的研究是第一个提供这样一种遗传HDGC照片,这可能有利于发展的诊断评估和治疗患者的GC。

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条信息万博manbetx平台首页

发表:2022年10月20日。

发表:2022年12月9日。doi:10.1001 / jamanetworkopen.2022.45836

开放:这是一个开放的分布式根据文章CC-BY许可证。刘©2022 ZX et al。狗万体育下载地址《美国医学会杂志》网络开放

相应的作者:Miao-Zhen邱,医学博士(qiumzh@sysucc.org.cn),瑞华徐,医学博士(xurh@sysucc.org.cn),医学肿瘤学部门,中山大学癌症中心,东风Rd 651 E, 510060年广州,中国。

作者的贡献:Drs邱和徐有完全访问所有的数据研究,负责数据的完整性和数据分析的准确性。张先生,刘博士博士和赵的贡献同样这项工作。

概念和设计:陈,他w . Wang,秋。

数据的采集、分析或解释:刘、张、赵,他盛,太阳,Lai,左,w . Wang周,F.-H。王,李。

起草的手稿:刘,他左,w . Wang周,秋。

关键的修订手稿的重要知识内容:张、赵、陈,他盛,太阳,Lai F.-H吴。王,李、徐秋。

统计分析:刘、张、赵,他赖,吴,周。

获得资助:刘,赵,秋。

行政、技术或材料支持:张、赵、盛,他阳光、李、邱。

监督:w . Wang F.-H。王、徐、秋。

利益冲突的披露:没有报道。

资金/支持:这项工作是2018年由格兰特yfc1313300中国国家重点研究和发展项目的(徐博士);拨款82073377(邱博士),82073377(邱博士),81972239(刘博士)和82172861(赵)博士从中国的国家自然科学基金;格兰特2021 a1515012439广东省自然科学基金(邱博士);授予2019年b020227002从广东的科技项目(徐博士);授予2019 - i2m 5 - 036摄像头创新基金的医学科学博士(徐);格兰特2017 zt07s096广东省引进创新和创业团队(刘博士);授予2019年tq05y351一流的科技创新型青年人才的广东特别支持项目(刘博士);格兰特2021 a1515011743广东基础研究和应用基础研究基金会(赵博士);科技项目的拨款202206080011广州(刘博士);并资助优秀青年人才培养计划和医学科学家计划中山大学癌症中心(邱博士)。

资助者的角色/赞助商:资金组织没有参与这项研究的设计和实施;的收集、管理、分析和解释数据;准备、审查或批准的手稿;并决定提交出版的手稿。

数据共享声明:看到补充3

额外的贡献:我们感谢所有的病人和他们的家属。

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