冠状病毒病的流行2019 (COVID-19)继续影响世界的很多地方。知识的诊断检测严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2 (SARS-CoV-2)仍然在发展,和一个清晰的理解的性质测试和解释他们的发现是重要的。这个观点描述如何解释两种诊断测试通常用于SARS-CoV-2 infections-reverse transcriptase-polymerase连锁反应(rt - pcr)和IgM和免疫球蛋白酶联免疫吸附试验(ELISA)——随着时间的推移,结果可能会有所不同(图)。
到目前为止,最常用的和可靠的测试诊断COVID-19已经执行的rt - pcr检测使用鼻咽拭子或其他上呼吸道标本,包括咽喉拭子或最近,唾液。各种RNA基因的目标是使用不同的制造商,与大多数测试目标1或更多的信封(env)、核衣壳(N),峰值(年代)、依赖RNA的RNA聚合酶(RdRp),ORF1基因。的敏感性测试单个基因具有可比性根据对比研究除了RdRp-SARSr(查利特)引物探针,有略低敏感性可能由于反向引物不匹配。1
在大多数患者症状COVID-19感染,病毒RNA的鼻咽拭子周期阈值(Ct)就可检测早在第一天的症状和山峰在症状出现的第一周之内。Ct是复制周期的数量要求产生荧光信号,代表更高的病毒RNA负载较低的Ct值。Ct值不到40临床报告为PCR阳性。本周积极性开始下降3,随后就检测不到。然而,Ct值获得的重病住院病人的Ct值低于温和的情况下,和PCR积极性可能会持续超过3周后疾病发作时最温和的情况下会产生一个负面的结果。2然而,一个“积极的”PCR的结果反映了只有病毒RNA的检测,不一定表示可行的病毒的存在。3
在某些情况下,病毒RNA已经被rt - pcr检测甚至超越第6周后第一个积极的测试。少数情况下也被报道积极执行2连续- PCR测试24小时后分开。目前还不清楚如果这是一个测试错误,再感染,或重新激活。在9个病人的一项研究中,试图隔离病毒文化没有成功超越第八天发病,这与传染性超出第一周的衰落。3这部分为什么“症状导向战略”的疾病控制和预防中心(CDC)表明,卫生保健工作者可以返回工作岗位,如果“至少3天(72小时)之后复苏定义为解决热不使用退烧药物和改善呼吸道症状(如咳嗽、气短);至少10天之后首次出现症状。”4
PCR积极性是不同的时间除了鼻咽拭子标本。PCR在痰积极性下降较慢,可能仍然是积极的在鼻咽拭子是负的。3在一项研究中,PCR积极性在凳子上观察到的96年55(57%)感染患者和保持积极的凳子上超越了鼻咽拭子的平均4到11天,但与临床严重程度无关。2持久性的PCR在唾液和粪便被发现类似评估Wolfel et al。3
205年的一项研究证实COVID-19患者感染,rt - pcr积极性最高的支气管肺泡灌洗的标本(93%),其次是痰(72%)、鼻拭子(63%),和咽拭子(32%)。5假阴性结果的发生主要是由于不恰当的时机的样本收集与疾病发病和缺乏抽样技术,尤其是鼻咽拭子。大部分的rt - pcr的特异性测试100%因为引物设计是特定于SARS-CoV-2的基因组序列。偶尔可能出现假阳性的结果由于技术错误和试剂污染。
COVID-19感染也可以间接地通过测量发现SARS-CoV-2感染宿主的免疫反应。血清学诊断尤为重要对于轻度至中度疾病患者可能出现晚,超越了前两周的疾病发作。血清学诊断也成为一个重要的工具来理解的程度COVID-19在社区和识别个体的免疫和潜在的“保护”感染。
最早、最敏感的血清学标记抗体,从第二周开始增加水平的症状出现。6尽管IgM和免疫球蛋白ELISA积极甚至发现了早在出现症状后第四天,高水平发生在第二和第三周的疾病。
例如,IgM和免疫球蛋白血清转化发生在所有患者之间的临床疾病的第三和第四星期开始衡量在23个患者et al7和85名患者et al。8此后IgM开始下降,达到较低水平的星期5星期7,几乎消失,而免疫球蛋白持续超过7周。9在140名患者的研究,结合PCR的灵敏度和IgM ELISA针对核衣壳(NC)抗原与单一PCR测试98.6% vs 51.9%。在第5.5天,比IgM定量PCR有较高的积极性,而IgM ELISA有更高的积极性后5.5天的疾病。10
ELISA-based IgM和免疫球蛋白抗体测试COVID-19大于95%的特异性诊断。配对血清样本的检测初始PCR和第二2周后可以进一步提高诊断准确性。一般来说,大多数的抗体产生针对病毒的最丰富的蛋白质,这是数控。因此,测试,检测抗体数控是最敏感的。然而,S (RBD-S)蛋白的受体结合域的主机连接蛋白和抗体RBD-S预计将更具体和中和。因此,使用一个或两个抗原检测免疫球蛋白g和IgM将导致高灵敏度。7然而,抗体可能与冠状大,可能其他冠状病毒。
快速的即时检测抗体的检测被广泛开发和销售和质量变量。许多制造商不暴露抗原的性质使用。这些测试在本质上是纯粹的定性,只能表明SARS-CoV-2抗体的存在与否。中和抗体的存在只能蚀斑减少中和试验证实了这一点。然而,高滴度的免疫球蛋白抗体ELISA可以探测到积极与中和抗体。7长期坚持和持续时间的保护授予的中和抗体仍是未知的。
使用可用的证据,临床有用的诊断标志物检测COVID-19时间表已经设计了(图)。大部分可用的数据为成年人群免疫功能不全的。PCR的积极性和儿童血清转化可能不同和其他组织,包括大量的无症状的个体去确诊没有积极监测。许多问题依然存在,特别是在个人潜在的免疫能持续多久,有症状和无症状感染SARS-CoV-2。
通讯作者:Sundararaj Stanleyraj耶利米,医学微生物学和分子生物学系的研究,横滨市立大学医学院3 - 9 Fukuura, Kanazawa-ku,日本横滨236 - 0004,(rediffjerry@gmail.com)。
网上发表:2020年5月6日。doi:10.1001 / jama.2020.8259
利益冲突的披露:没有报道。