疫苗有效性的分析对COVID-19和三角洲的出现和其他变体在犹他州的担忧

自从SARS-CoV-2的出现,疫苗一直被视为最好的方法减少COVID-19大流行。临床试验显示SARS-CoV-2疫苗非常有效的疾病和感染。¹然而,这些在目前使用的疫苗主要是测试对早期的血统。疫苗有效性数据变异的担忧(挥发性有机化合物的仪器)仍然有限,包括三角洲变体(B.1.617.2)。

和光的传播传播能力显著升高(如δ变种),引发了担忧疫苗SARS-CoV-2可持续控制的能力。这些担忧加剧的报告越来越多的病例在充分接种个人三角洲变体蔓延全球,可能信号降低疫苗的有效性对挥发性有机化合物的仪器。²一项初步研究³在英国的疫苗有效性BNT162b2(辉瑞/ BioNTech)和ChAdOx1(阿斯利康)疫苗发现减少6%的功效BNT162b2 ChAdOx1疫苗疫苗和减少了12%。然而,由于三角洲最近的出现和较低的病例数,本研究只包括27个充分接种疫苗情况下。

这个横断面研究使用加强流行病学观察研究(的报告选通脉冲)报告指南。这项工作是基于公开数据,因此认为不是人类参与者研究也需要知情同意,根据共同的规则。

犹他州卫生部门(UDOH)在2020年10月开始监控挥发性有机化合物的仪器,首次发现在2021年4月中旬与δ2例。⁴在这个分析中,我们使用从UDOH公开数据,⁴包括每天链接数量的情况下与他们的疫苗接种状态和比例的变异情况。目前,UDOH序列报告病例的10%,所有病例收集疫苗接种覆盖率。

突破性的情况下在犹他州的百分比是增加速度有关(图1)和δ的出现和传播(图2)。确定疫苗的有效性部署在犹他州对SARS-CoV-2检测呈阳性,我们估计合并后的日常疫苗效力(VE_t在奥伦斯坦)使用现场评价方法等。⁵然后我们扩展这种方法理解的速度突破感染变异格局急剧变化。估计疫苗有效性对三角洲,我们分区VE_t到疫苗的有效性(VE三角洲变体_δ)和所有其他变异的疫苗有效性(VE₁- - - - - -_δ),这样已经_t=我₁- - - - - -_δ×P₁- - - - - -_δ+ VE_δ×P_δ,与P_δ测序的比例情况下,来自三角洲变体,和P_{1 -δ}的比例排序不是δ。

R版本操作(统计计算的R项目)用于计算,和数据分析了从2021年1月到10月。没有统计测试进行这种分析的一部分。

截至2021年10月18日,726  946 3 205 958 Utahans(66.6%)的合格的人充分接种疫苗,这被定义为超过14天之后最后的疫苗剂量;982 938(57.1%)与BNT162b2疫苗,592 801(34.4%)的mrna - 1273(现代化)疫苗,并与公司147 193(8.53%)- 78436735(强生)疫苗。⁴突破的情况下开始增加快于预期的比例人口疫苗接种率在5月中旬(图1),542年达到79例(14.6%)在6月底前vs 35(6.4%)的人口如预期90%的有效疫苗。我们估计的有效从所有接种疫苗的有效性在犹他州从1月16日到10月15日,2021 (图2),发现疫苗效果从90%下降(95%可信区间,88% -92%)在5月中旬低点78%(95%可信区间,76% -79%)在8月中旬之前反弹至81%(95%可信区间,80% -82%)在10月(图2这个下降同时发生)。作为一个快速增长的比例情况下感染了三角洲变体(图2B)。自从发现第一例δ,三角洲迅速超过所有其他变体,截至10月3日,2021年,它代表了所有SARS-CoV-2病毒测序在犹他州的93.3% (图2B)。如果我们把整个改变疫苗有效性的三角洲变体(ie、VE_t=我₁- - - - - -_δ×P₁- - - - - -_δ+ VE_δ×P_δ),估计疫苗有效性对三角洲将为81.2%(95%可信区间,80.8% -81.6%)。

我们的研究结果建议适度降低疫苗的有效性对COVID-19在犹他州与三角洲血统的扩张。这减少疫苗的有效性与小说的到来挥发性有机化合物的仪器,而不是减弱免疫有关。这些应该作为一个警告在美国三角洲变体可以带来新的疫情,即使在高接种疫苗的人群。如果有一致的趋势,增加免疫逃避新的变种,它最终可能破坏现有疫苗的有效性,需要大规模复种。

这个研究是有限的。我们使用公开数据,收集疫情监测。突破自我报告的病例定义允许疫苗接种的地位,导致完全接种疫苗的个人报告以更高的利率(即10% overreporting疫苗接种将疫苗有效性的83.8%)。同时,每天只有10% to15%例测序,优先突破病例和疫情,可能导致三角洲变异的过采样。此外,有一个2周的延迟报告序列数据;因此,估计2周突破感染变异是滞后的。此外,我们不知道占人口统计学差异(如城市化)在未接种疫苗和突破性的感染。虽然趋势之间的关系在三角洲和观察到的疫苗有效性符合减少疫苗有效性与三角洲的崛起,我们不能排除的可能性诱发的免疫发挥一些作用的减弱与可用的数据。

发表:2021年11月1日。

发表:2021年12月23日。doi:10.1001 / jamanetworkopen.2021.40906

开放:这是一个开放的分布式根据文章CC-BY许可证。©2021基冈LT et al。狗万体育下载地址《美国医学会杂志》网络开放。

通讯作者:林赛·t·基冈博士的流行病学,内科,犹他大学,295年Chipeta,盐湖城,UT 84108 (lindsay.keegan@utah.edu)。

作者的贡献:Drs基冈和Lessler完全访问所有的数据研究,负责数据的完整性和数据分析的准确性。

概念和设计:所有作者。

数据的采集、分析或解释:基冈,爱人。

起草的手稿:所有作者。

关键的修订手稿的重要知识内容:所有作者。

统计分析:所有作者。

获得资助:基冈。

行政、技术或材料支持:基冈。

利益冲突的披露:基冈博士报道接受美国国立卫生研究院(NIH)和接收从辉瑞和研究合同正欲研究外提交的工作。Lessler博士报道收到来自美国国立卫生研究院的资助和美国卫生和人类服务部、服务作为专家证人科恩Ziffer法国和麦肯纳病例相关COVID-19外提交的工作。爱人博士报道SARS-CoV-2传播咨询,工作之外提交的建模和预测的影响。没有其他信息披露报告。

资金/支持:基冈博士被授予5 u01ck000585-02 5 u01ck000555-02支持从美国疾病控制和预防中心。博士爱人由国家科学基金会支持COVID-19快速奖。Drs爱人和Lessler支持由美国健康和人类服务部门,办公室助理国务卿的防范和应对约翰霍普金斯大学应用物理实验室。

资助者的角色/赞助商:资助者没有参与这项研究的设计和实施;的收集、管理、分析和解释数据;准备、审查或批准的手稿;并决定提交出版的手稿。

额外的贡献:我们感谢犹他州卫生部门的不懈努力下,收集和共享数据SARS-CoV-2感染、免疫接种和测序。